倉庫委託契約書は、ひな形をそのまま使うのではなく、まず「倉庫を借りるのか」「貨物の保管・管理を任せるのか」「入出庫や出荷作業まで委託するのか」を分けて作成します。契約形態を決めたうえで、業務範囲、貨物条件、料金、事故時の責任、契約終了後の処理を実際の運用に合わせて具体化することが重要です。
特に、保管中の破損・紛失だけでなく、誤出荷、在庫差異、作業遅延、荷主側の指示ミスまで想定し、誰が何を確認し、どの基準で報告・補償するかを契約書と別紙に落とし込みます。継続的な3PL型の委託では、KPIや改善効果の扱いも先に合意しておくと、運用開始後の認識違いを抑えやすくなります。
倉庫委託契約書は「何を任せるか」から決める
倉庫委託契約書の対象は、貨物の保管・管理なのか、庫内作業なのか、倉庫スペースの利用なのかを最初に整理します。対象が違えば、誰が貨物を管理し、誰が庫内運営を担い、料金や事故時の責任を負うかも変わるためです。
倉庫委託契約書を作るときは、契約書の名称よりも実際の運用を先に確認します。自社が商品を預け、倉庫業者が保管・在庫管理・入出庫を行うのか、自社がスペースを借りて人員や設備を手配するのかを明確にすると、後続の条項を適切に設計できます。
保管委託・庫内作業の委託・倉庫賃貸借を区別する

保管委託は、荷主が貨物を倉庫業者に預け、保管・管理を任せる契約です。庫内作業の委託は、保管に加えて入庫検品、荷役、ピッキング、梱包、出荷、在庫管理、流通加工などを任せる形です。
一方、倉庫賃貸借は、倉庫スペースを借りて自社で庫内運営を行う契約です。自社がレイアウト、人員、設備、在庫管理方法を決める代わりに、貨物管理や運営上の責任も自社側に残ります。物量が安定し、独自設備を組み込みたい場合に検討しやすい一方、物量が減っても賃料や管理費が発生しやすい点に注意が必要です。
判断の軸は、貨物を預けて管理まで任せるか、作業だけを任せるか、スペースを借りて自社で運営するかです。保管責任と庫内運営を倉庫業者に移すほど、契約書では作業範囲・品質基準・事故時の責任を細かく定めます。
契約前に委託先の営業形態と対応能力を確かめる
第三者の貨物を有償で保管する営業倉庫を利用する場合は、倉庫業法に基づく登録を受けているかを確認します。国土交通省は、営業倉庫について、保管物品に応じた施設基準を満たし、倉庫管理主任者を選任することなどが登録要件になると案内しています。登録の有無だけで品質や補償内容が決まるわけではないため、国土交通省の倉庫業法に関する案内を入口に、契約対象となる倉庫の登録状況や対象棟を確認します。
ただし、掲載されている登録倉庫事業者棟別リストは令和6年3月31日時点の情報です。契約時点の登録状態、実際に貨物を保管する棟、対象貨物を保管できる区分は、倉庫業者の資料や所管運輸局への照会を含めて確認します。
契約前には、貨物の種類・重量・サイズ・温湿度条件に合う設備、入出庫や棚卸を担う作業体制、繁忙期の対応力、データ連携方法、保険の対象事故・金額・免責・証明方法を確認します。
委託範囲・貨物条件・変更手続を具体化する
「保管一式」「物流業務一式」のような表現だけでは、追加作業や事故時の責任を判断できません。本文では委託する業務の大枠を定め、別紙や手順書で日々の作業条件を具体化します。
業務範囲、貨物条件、変更手続を一体で設計すると、作業が増えたときに料金や責任の見直しへつなげやすくなります。
本文には業務の範囲、別紙には作業の細目を置く

本文には、保管、入庫、出庫、荷役、検品、棚卸、在庫管理、ピッキング、梱包、出荷、配送、返品、流通加工など、委託する業務の範囲を記載します。委託しない業務や、別途協議が必要な作業も示しておくと、想定外の作業をめぐる争いを減らせます。
別紙や手順書には、入荷受付の曜日・時間、出荷指示の方法、出荷締切、検品の範囲、ピッキングや梱包の手順、在庫報告、棚卸、返品・交換・廃棄、配送業者への引渡し時点などを置きます。
業務の細目は運用開始後に変更されることがあります。国土交通省の3PL契約書ガイドラインも、業務範囲と業務細目を分け、細目の変更方法を定める考え方を示しています。同ガイドラインは個別契約のひな形や現行の法的義務を示すものではないため、自社の業務条件に合わせて調整します。
貨物の取扱条件は保管方法と責任判断につながる
貨物条件は、保管方法だけでなく、料金、作業可否、事故原因の判定、保険の補償範囲にも関係します。契約書や別紙には、次の情報を整理します。
- 商品の種類、SKUや数量の管理単位、荷姿、重量、サイズ
- 価額や高額品に該当するかどうか
- 常温、定温、冷蔵、冷凍などの保管環境と温湿度条件
- 賞味期限・消費期限・使用期限、ロット、先入れ先出しの要否
- 危険性、破損しやすさ、盗難対策、取扱注意事項
- ラベル、バーコード、梱包、開封検品、セット組みの条件
- 予定数量、通常時・繁忙期の物量、入出庫の波動
特殊貨物は「対応可能」とだけ書かず、どの設備・作業・監視方法で対応するかを確認します。荷主が貨物の性質や注意事項を伝えていなかった場合と、倉庫業者が合意した条件を守らなかった場合では、責任の判断が変わるためです。
物量・作業・貨物条件が変わる場合の承認方法を決める
物量増加、繁忙期対応、追加の検品・梱包、出荷締切の変更、貨物の温度帯や荷姿の変更が起きたときに、現場判断だけで作業や料金を変えない仕組みを設けます。
契約書では、変更の申出者、承認する担当者、適用日、必要な人員・設備の負担者、料金・手順・品質基準の改定方法、合意前の暫定対応を決めます。
基本契約の本文を毎回変更するのではなく、業務細目・料金表・作業手順を別紙や覚書で改定する方法もあります。その場合は、改定日、対象範囲、旧資料との優先関係、承認者を明記します。
料金・請求・価格改定を業務範囲と結び付ける
倉庫委託の料金は、保管料だけで決まりません。保管量・期間、入出庫回数、検品やピッキングの数量、梱包方法、特殊保管、返品など、委託する業務の範囲と算定単位が料金を左右します。
料金表は費目と算定単位を分けて作り、請求条件や価格改定の手続まで含めて設計します。
料金表で費目と算定単位を分ける

| 費目 | 定める内容の例 |
|---|---|
| 保管料 | パレット、棚、容積、個数、期間などの算定単位 |
| 入庫・出庫費 | 入出庫の件数、個数、ケース、パレットなどの単位 |
| 荷役・検品費 | 作業回数、個数、時間、検品内容などの単位 |
| ピッキング・梱包費 | 注文件数、商品点数、梱包単位、資材の扱い |
| 特別作業費 | ラベル貼付、セット組み、返品、緊急対応などの発生条件 |
| 特殊保管費 | 温度帯、防犯、期限管理などに必要な追加条件 |
固定料金は物量や作業量が比較的安定している運用に向きます。従量料金は、季節変動や受注変動が大きい場合に実際の利用量と費用を対応させやすい方式です。固定と従量を組み合わせる混合方式は、最低限必要な設備・人員の費用と、変動する作業費を分けたい場合に使いやすくなります。
保管料に含まれる作業と、追加請求の対象になる作業を明確にしないと、契約後に「基本料金に含まれると思っていた」という問題が起きます。
請求条件と料金改定のルールを明記する
請求締め日、請求書の発行方法、支払期限、支払方法、消費税の扱い、振込手数料の負担者、支払遅延時の扱いを定めます。料金表を参照する場合は、料金表の版、適用開始日、改定履歴も管理します。
価格改定については、「協議する」とだけ書かず、物量や作業内容、保管条件、人件費・燃料費など、何が変わったときに見直すかを決めます。当事者が資料を示して協議し、書面または覚書で合意した日から新料金を適用する、といった流れを定めます。具体的な改定率や算定式は、取引条件や費用構造に応じて設定します。
保管品質・事故対応・賠償・保険の境界を決める
事故条項は、賠償額だけを決めるものではありません。事故の定義、報告、初動、原因調査、責任判定、賠償、保険を一続きに設計します。
保管・在庫・出荷の品質基準を業務ごとに定め、倉庫業者の作業ミスと、荷主の指示・データ・貨物情報の不備を切り分けられるようにします。
品質基準と事故の定義を業務別に定める
品質基準は、委託した業務に対応させます。保管では保管環境や期限管理、在庫では棚卸方法・在庫精度、出荷ではピッキング精度・梱包・引渡し時刻などを対象にします。
事故には、破損、汚損、紛失、盗難、火災、水害、誤出荷、数量差異、品質低下を含めるかを整理します。貨物の損害だけでなく、入出庫の遅延、出荷遅延、業務の不履行を事故または別の債務不履行として扱うかも定義します。
事故報告・初動対応・原因調査の役割を決める

事故時には、誰が、どの連絡先へ、どの期限までに、何を報告するかを定めます。発生日時、場所、対象貨物、数量、被害状況、出荷への影響、現場で取った措置、証跡の有無を報告内容に含めると、原因調査につなげやすくなります。
初動対応では、被害拡大の防止、対象在庫や出荷の一時停止、代替出荷、配送会社や警察などへの連絡、証拠・ログ・写真の保存を誰が担うかを決めます。連絡先がつながらない場合の代替連絡先も定めます。
原因調査では、倉庫側の記録・作業ログと、荷主側の発注情報・出荷指示・商品マスター・配送情報を突き合わせます。荷主の指示ミス、倉庫側の作業ミス、配送中の事故、引渡し後に判明した損害を一律に倉庫業者の責任とせず、原因と管理範囲を確認します。
賠償範囲・上限・不可抗力・保険を一体で設計する
賠償条項では、対象損害、商品価額・仕入価額・売価などの算定基準、運送費や代替手配費などの付随費用、1事故当たりの上限、在庫差異、請求期限を定めます。
天災、暴動、法令の制定・改廃、公権力の命令などを不可抗力として扱う場合も、免責を無制限に広げず、連絡、被害拡大防止、貨物保全、復旧協議の義務を残すかを決めます。
保険は、誰が保管中・作業中・輸送中のどの損害に備えるかを確認します。保険金額や免責が契約上の賠償上限と合っているか、対象外の貨物がないか、保険証明の提出や契約変更・解約時の通知を求めるかも整理します。国土交通省の3PL契約書ガイドラインは、損害賠償と損害保険を契約上の検討項目として挙げていますが、保険金額などの一律基準を示すものではありません。
契約期間・更新・終了時の負担を先に決める
継続委託では、契約開始時だけでなく、更新時と終了時の負担を先に決めます。専用設備、情報システム、人員配置、倉庫改修などの個別投資がある場合、短い契約期間や突然の終了が投資負担の争いにつながるためです。
契約期間、更新、任意の中途解約、契約違反による解除を別々に整理し、終了時の貨物・設備・システム・精算まで一続きで定めます。
契約期間と更新条件を投資・利用計画に合わせる
契約期間は、利用予定だけでなく、専用の倉庫設備、棚、機器、WMS連携、システム開発、人員採用などの投資期間と整合させます。投資を誰が負担し、契約終了時に誰が所有し、残額をどのように精算するかも確認します。
更新方法は、自動更新と再協議型に分けて考えます。自動更新は継続しやすい一方、料金や業務条件の見直し機会を逃しやすくなります。再協議型は条件を確認できますが、合意できない場合の取扱いが必要です。更新拒絶、条件変更、料金改定の通知期限と通知方法も明記します。
中途解約と解除を区別し、終了後の処理を定める
任意の中途解約は、契約違反がなくても将来に向けて契約を終了する仕組みです。予告期間、解約日までの料金、作業継続、貨物引取り、投資や解約費用の精算を定めます。
解除は、債務不履行、重大な契約違反、信用不安、差押え・破産、営業停止などを理由とする終了です。是正可能な違反では、一定期間内の是正を求めてから解除するのか、重大な事由では催告なしに解除できるのかを区別します。
終了時には、貨物の引取り期限、未払い料金、返品・廃棄、在庫データの移管、システム停止、設備の撤去・譲渡、リース、未償却投資、原状回復費用を整理します。
日常運用を支える役割分担と統制を整える
物流業務は、倉庫業者だけでは完結しません。荷主が正しい情報と指示を提供し、倉庫業者が合意した手順で作業し、再委託先を含めて情報と品質を管理する体制が必要です。
契約書には、日常運用の役割分担と、契約にない問題が起きたときの協議・紛争対応を置きます。
荷主の協力事項と再委託の条件を定める
荷主は、商品情報、荷姿、保管条件、危険性、期限、出荷指示、商品マスター、納品先データ、必要な記録を、いつ、どの形式で提供するかを定めます。情報の誤り・遅延によって作業や品質に影響が出た場合の扱いも明確にします。
再委託を認める場合は、範囲、事前承諾、変更通知、管理水準、監査・報告、再委託先の事故責任を定めます。国土交通省の3PL契約書ガイドラインも、再委託の範囲と再委託先の行為に対する責任を検討項目としています。
秘密情報・価格情報・紛争対応のルールを置く
秘密情報には、商品情報、顧客情報、出荷情報、価格、販売計画、在庫情報、業務手順、再委託先や入札参加者の見積情報などが含まれ得ます。対象情報、利用目的、アクセス担当者、再委託先への開示条件、法令に基づく開示の例外を定めます。
契約終了後の返還・消去、バックアップ、漏えい時の通知、違反時の責任も確認します。契約にない問題については、協議の開始方法、窓口、記録、暫定対応を定め、準拠法と合意管轄は所在地や紛争対応の負担を踏まえて設定します。
継続的な3PL委託ではKPIと改善効果も合意する
KPI(重要業績評価指標)は、単なる保管ではなく、継続的な品質改善やコスト改善まで期待する3PL型の委託で特に有効です。単発の保管や作業委託に過度な指標を置くと、現場負荷や追加費用だけが増えることがあります。
KPIを契約に入れる場合は、目標値だけでなく、何をどのデータで測り、未達時にどう改善するかまで合意します。
KPIは評価対象・データ・未達時の対応まで決める

誤出荷率、在庫精度、棚卸差異、入出庫・出荷リードタイム、破損・紛失件数、納期達成度、請求精度、作業生産性、コストなどから指標を選びます。
各KPIについて、指標の定義、分母・分子、目標値、元データ、取得者、評価開始日・期間・頻度、報告方法、立ち上げ期間の扱い、未達時の是正、環境変化時の見直しを定めます。
改善効果を配分する場合は測定基準を先に決める
改善効果を配分する場合は、改善前の基準時点、比較対象となる費用・品質、効果の算定方法、対象期間、証拠となるデータを先に定めます。
目標達成時の配分、目標超過時の扱い、目標未達時の負担、改善投資費用、外部要因による効果の除外を、KPIと同じ資料で管理します。
ひな形は基本契約・別紙・手順書に分けて使う
ひな形は、当事者、目的、業務範囲、料金、期間、事故、賠償、保険、再委託、秘密保持、解約・解除などの条項漏れを確認する出発点として使います。ただし、ひな形の文言を残したまま契約名称だけを変えても、自社の物流条件には適合しません。
基本契約、業務別の別紙、料金表、現場手順書、変更覚書を役割ごとに分けると、継続運用で変わる条件を管理しやすくなります。
ひな形から必ず見直す項目
当事者、対象倉庫、契約期間、更新、解約・解除、委託範囲、貨物条件、料金、品質基準、事故・賠償・保険、荷主の協力、再委託、秘密情報、終了時の貨物・設備・投資・精算を、自社の取引条件に合わせて見直します。
契約書の条項と、見積書・提案書・業務フロー・倉庫の運用説明が一致しているかも確認します。契約書に書かれていないサービスを営業資料だけで前提にしないことが重要です。
別紙・料金表・手順書・覚書の役割を分ける

基本契約には、継続的に変わりにくい権利義務、責任、秘密保持、期間、終了、紛争対応を置きます。別紙には対象貨物、業務範囲、倉庫、保管条件、作業時間などの個別条件を記載します。
料金表には費目・算定単位・追加料金・適用日を、手順書には指示方法、検品、在庫報告、出荷、返品、事故連絡の流れを置きます。物量や業務内容の変更は覚書や別紙改定で管理し、優先関係、承認者、適用日、改定権限を残します。
まとめ
倉庫委託契約書は、倉庫スペースを借りるのか、貨物の保管・管理や庫内作業を委託するのかを区別して作成します。そのうえで、業務範囲と貨物条件、料金の算定単位と改定手続、事故時の報告・責任・補償、契約終了時の貨物・設備・投資の処理を、相互に矛盾しない形で定めます。
荷主の情報提供、再委託、秘密情報、委託先の登録・設備・保険も確認します。継続的な3PL委託で改善を期待する場合だけ、KPIや改善効果の配分まで具体化します。
ひな形は条項漏れを防ぐための土台にとどめ、基本契約、別紙、料金表、手順書、覚書を自社の物流実態に合わせて整えます。


